Términos relacionados

4 resultados encontrados para: TEMA: ADN mitocondrial
  • «
  • 1 de 1
  • »
1.
Artículo
*Solicítelo con su bibliotecario/a
Accessing cryptic diversity in Neotropical rattlesnakes (Serpentes: Viperidae: Crotalus) with the description of two new species
Carbajal Márquez, Rubén Alonso (autor) ; Cedeño-Vázquez, J.R. (autor) ; Martínez Arce, Arely (autora) ; Neri Castro, Edgar (autor) ; Machkour M'Rabet, Salima (autora) ;
Contenido en: Zootaxa Vol. 4729, no. 4 (January 2020), p. 451-481 ISSN: 1175-5334
Nota: Solicítelo con su bibliotecario/a
Resumen en español

Los miembros del complejo de especies Crotalus durissus tienen una amplia distribución desde México hasta Argentina, principalmente en zonas con bosque tropical deciduo. Aunque se reconocen actualmente cuatro especies (C. culminatus, C. durissus, C. simus y C. tzabcan), los límites entre estas no son claros. Estudios genéticos previos sugieren que C. durissus y C. simus pueden ser parafiléticos y que al menos una especie críptica puede estar presente. Analizamos una secuencia de 2596 pares de bases de ADN provenientes de tres genes mitocondriales y uno nuclear, para inferir las relaciones filogenéticas en las especies de víboras de cascabel neotropicales. Por otro lado, se examinaron especímenes de museo, silvestres y ejemplares en cautiverio para analizar caracteres morfológicos. Nuestros resultados sugieren que la taxonomía actual del grupo de especies Crotalus durissus no refleja su historia evolutiva. Los resultados obtenidos muestran un fuerte apoyo para cinco linajes independientes en Crotalus simus (sensu lato) con evidencia genética y morfológica para tres taxones previamente reconocidos y dos especies nuevas, y tres linajes en C. durissus, que representan hipótesis de especies para ser probadas con evidencia adicional. También encontramos apoyo para mantener a C. totonacus en el complejo de especies Crotalus molossus. Sugerimos cambios taxonómicos conservadores para el complejo y especies relacionadas, pero se necesita más evidencia (e.g., morfología, ecología y composición bioquímica del veneno), para aclarar las relaciones entre especies.

Resumen en inglés

Members of the Crotalus durissus species complex are widely distributed from Mexico to Argentina in areas with mainly seasonally dry tropical deciduous forest. Although four species (C. culminatus, C. durissus, C. simus and C. tzabcan) are currently recognized, species limits remain to be tested. Previous genetic studies suggest that C. durissus and C. simus may be paraphyletic and that at least one cryptic species may be present. We analyzed 2596 bp of DNA sequence data from three mitochondrial and one nuclear gene to infer phylogenetic relationships in the Neotropical rattlesnakes. We also examined museum and wild specimens as well as captive animals to analyze morphological characters. Our results suggest that current taxonomy of the Crotalus durissus species complex does not reflect evolutionary history. We found strong support for five independent lineages within Crotalus simus (sensu lato), with genetic and morphological evidence for three previously recognized taxa and two new species, as well as three major lineages within C. durissus that each represent species hypothesis to be tested with additional evidence. We also found support to retain C. totonacus in the Crotalus molossus species complex. We suggest conservative taxonomic changes to the complex and related species, but more evidence is needed (e.g., morphology, ecology and venom composition) to clarify relationships among species.


2.
Artículo
*Solicítelo con su bibliotecario/a
Phylogeography of ants from the Brazilian Atlantic Forest
Ströher, Patrícia R. (autora) ; Meyer, Andreas L. S. (autor) ; Zarza Franco, Guadalupe Eugenia (autora) ; Tsai, Whitney L. E. (autora) ; McCormack, John E. (autor) ; Pie, Marcio R. (autor) ;
Contenido en: Organisms Diversity & Evolution Vol. 19, no. 3 (2019), p. 435-445 ISSN: 1618-1077
Nota: Solicítelo con su bibliotecario/a
Resumen en: Inglés |
Resumen en inglés

Known for its remarkable biodiversity and high levels of endemism, the Brazilian Atlantic Rainforest has been characterized as one of the most threatened biomes on the planet. Despite strong interest in recent years, we still lacka comprehensive scenario to explain the origin and maintenance of diversity in this region, partially given the relatively low power of analyses involving few independent genetic loci. In this study, we examine a phylogenomic dataset of five ant species to investigate phylogeographical patterns across the Brazilian Atlantic Forest. We sequenced ultraconserved elements to generate hundreds of loci usinga bait set developed specifically for hymenopterans. We analyzed the data using Bayesian and maximum likelihood approaches of phylogenetic inference. Results were then integrated with environmental niche modeling of current and past climates, including the Last Glacial Maximum and the last interglacial period. The studied species showed differentiation patterns that were consistent with the north/south division of the Atlantic Rainforest indicated in previous studies for other taxa.

However, there were differences among species, both in the location of phylogeographic breaks and in the pattern of genetic variation within these areas. Samples from southern localities tended to show recent genetic structure, although a site in Tapiraí (state of São Paulo) repeatedly showed an intriguing older history of differentiation. All species experienced shifts in areas of suitability through the time. Our study suggests that distinct groups may have responded idiosyncratically to the climatic changes that took place in the Brazilian Atlantic Forest. The amount of intraspecific genetic structure was related to the inferred geographical distribution of habitat suitability according to current and past times. Also, a parallel between the amount of Quaternary climatic suitability and the level of interspecific differentiation was detected for four species. Finally, despite strong contractions at the northeastern region of the forest, the remaining areas appear to have been able to act as refugia.


3.
Tesis - Maestría
Efecto de la estructura del paisaje en la diversidad genética de Artibeus jamaicensis Leach, 1821: un enfoque espacialmente explícito / Elida María Leiva González
Leiva González, Elida María ; Navarrete Gutiérrez, Darío Alejandro (director) ; Ruiz Montoya, Lorena (asesora) (1964-) ; Santos Moreno, Antonio (asesor) ;
San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, México : El Colegio de la Frontera Sur , 2018
Clasificación: TE/599.45097275 / L45
Bibliotecas: San Cristóbal
Cerrar
SIBE San Cristóbal
ECO010019546 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
PDF
Índice | Resumen en: Español |
Resumen en español

Se asume que los murciélagos debido a su capacidad de vuelo no son afectados de forma negativa por la pérdida y fragmentación de bosques, esto en términos de riqueza y abundancias. Sin embargo, estudios recientes han encontrado evidencias de respuestas negativas a la fragmentación del paisaje sobre la diversidad genética de algunas especies de murciélagos filostómidos. En específico, estos estudios han encontrado una respuesta negativa a una escala geográfica pequeña y en matrices dominadas por prácticas agrícolas. El objetivo principal del presente estudio fue evaluar atributos de la estructura del paisaje (composición y configuración) que podrían estar influenciando la diversidad genética de Artibeus jamaicensis Leach, 1821 (Chiroptera: Phyllostomidae) en un área caracterizada por la presencia de extensos terrenos agrícolas. El estudio se llevó a cabo en un área que incluye al Parque Nacional Lagunas de Montebello (PNLM) y fragmentos boscosos ubicados en sus alrededores. A través de secuencias de la región control de ADN mitocondrial se estimó la diversidad genética de poblaciones de A. jamaicensis en el área de estudio, la cual se relacionó con atributos del paisaje obtenidos a partir de la caracterización con métricas que describen aspectos de composición y configuración, como el porcentaje de bosque y el grado de aislamiento de los fragmentos de bosque. Para determinar esta posible relación, se empleó un análisis exploratorio que permitió conocer la contribución independiente de cada atributo del paisaje sobre la diversidad genética. Se encontró que aspectos relacionados con la configuración de los paisajes (cantidad de borde en los paisajes), presentaron contribuciones significativas sobre diversidad genética.

Índice

Resumen
Introducción
La transformación del paisaje: pérdida y fragmentación de bosques
Diversidad genética
Estructura genética
ADN mitocondrial como marcador molecular
Erosión genética como consecuencia de la transformación del paisaje
Murciélagos como modelo de estudio
Antecedentes
Estudios sobre los efectos de la transformación del paisaje sobre murciélagos
Artibeus jamaicensis: generalidades
Artibeus jamaicensis: diversidad y estructura genética
Hipótesis
Objetivos
Materiales y Métodos
Área de estudio y sitios de muestreo
Trabajo de campo
Caracterización del paisaje
Procesamiento de imágenes satelitales
Cálculo de métricas de composición y configuración de los paisajes
Trabajo de laboratorio
Extracción, amplificación y secuenciación
Análisis de diversidad genética
Análisis de estructura genética
Análisis de datos
Análisis de partición jerárquica
Correlaciones de Spearman
Resultados
Caracterización de los paisajes
Diversidad genética
Estructura genética
Efecto de la estructura del paisaje sobre la diversidad genética
Discusión
Diversidad genética
Estructura genética
Efecto de la estructura del paisaje sobre la diversidad genética
El flujo de genes en el ADN mitocondrial
La importancia de la escala espacial
Implicaciones para la conservación
Conclusiones
Recomendaciones
Literatura Citada
Anexos


PDF
Resumen en: Inglés |
Resumen en inglés

The genus Octopus occurs in tropical and temperate oceanic waters throughout the world, and currently includes 112 species, although the phylogenetic relationships among the different taxa are still poorly understood. The cosmopolitan Octopus vulgaris is one of the most widely analyzed cephalopods in genetic studies, primarily because of its ample range and the problems associated with the morphological identification of specimens, which indicate the possible existence of a species complex with a worldwide distribution. Two large-bodied octopus species—O. vulgaris and Octopus insularis—are found in the western South Atlantic. The limits of the geographical range of the O. insularis are still unclear. The current study is based on a phylogeographic analysis of the 2 species in the South Atlantic, with the objective of confirming their monophyletic status and the limits of their geographical distribution in this region. The analyses were based on the mitochondrial genes 16S rDNA and Cytochrome Oxidase subunit I (COI). The topologies generated for both genes confirmed the monophyletíc status of the 2 species. In the case of O. vulgaris, it was possible to confirm the monophyletic status of the specimens from this region relative to those of other areas around the world, although 3 distinct haplogroups were clearly differentiated, corresponding to the Americas, Europe and Africa, and Asia. The differentiation among these 3 groups may be determined by the limitations of the dispersal of paralarvae among continents. Further studies are needed to confirm the possible occurrence of distinct groups in the western South Atlantic, as well as the influence of oceanic currents on the phylogeographical distribution of O. vulgaris on the Brazilian coast.