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6 resultados encontrados para: TEMA: Aguachil, San Francisco del Mar (Oaxaca, México)
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1.
Artículo
Variation and genetic structure of the endangered Lepus flavigularis (Lagomorpha: Leporidae)
Cruz Salazar, Bárbara (coaut.) ; Lorenzo Monterrubio, Consuelo (coaut.) ; Espinoza Medinilla, Eduardo E. (coaut.) ; López Mendoza, Sergio (coaut.) ;
Contenido en: Revista de Biologia Tropical Vol. 65, no. 4 (December 2017), p. 1322-1336 ISSN: 0034-7744
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Resumen en: Español | Inglés |
Resumen en español

Lepus flavigularis es una especie endémica y en peligro, con solo cuatro poblaciones ubicadas en Oaxaca, México: Montecillo Santa Cruz, Aguachil, San Francisco del Mar Viejo y Santa María del Mar. Las actividades humanas (e.g. cacería, cambios de uso de suelo) y la baja diversidad genética detectada con ADN mitocondrial y aloenzimas muestran la urgencia de desarrollar estrategias de manejo para esta especie. Para definir unidades de manejo es necesario estudiar la estructura genética con genes nucleares debido a su herencia y alto polimorfismo, por lo tanto, el objetivo de este estudio fue examinar la variación y estructura genética de L. flavigularis con microsatélites nucleares. Se obtuvo el ADN genómico de 67 liebres de las cuatro poblaciones de L. flavigularis, capturadas mediante muestreo nocturno de 2001 a 2006, mediante el método fenol-cloroformo-alcohol isoamílico. Para obtener la diversidad y estructura genética se amplificaron siete microsatélites con la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Las amplificaciones se visualizaron mediante electroforesis con geles de poliacrilamida al 10 %, teñidas con bromuro de etidio. La diversidad genética se determinó con el programa GenAlEx v.6.4, y la estructura genética se obtuvo con el ARLEQUIN v.3.1. Se evaluaron los alelos nulos con el programa Micro-Checker v.2.2.2.

Adicionalmente, se realizó un análisis bayesiano con el software STRUCTURE v.2.2.3, y se estudió el aislamiento por distancia (IBD) mediante el programa PASSAGE v.2.0.11.6. La variación genética encontrada fue baja (Hо = 0.30, HE = 0.24) en comparación con otras especies de liebres. Se detectaron alelos fijos y diferenciación genética moderada (F ST = 0.18, P < 0.001) entre las poblaciones, lo que indica el efecto de la deriva genética y flujo genético limitado. El análisis Bayesiano reveló dos grupos: (1) liebres de Montecillo Santa Cruz, e (2) individuos de Aguachil, San Francisco del Mar Viejo y Santa María del Mar. No se detectó evidencia de aislamiento por distancia. Es posible que las barreras geográficas presentes entre las poblaciones (e.g. lagunas, asentamientos humanos), más que la distancia geográfica entre ellas, expliquen la estructura genética observada. El coeficiente de endogamia fue negativo ( F IS = -0.27, P = 0.03), indicando sub-estructura genética en las poblaciones. Sugerimos dos unidades de manejo con base en las poblaciones más cercanas genéticamente, lo que ayudará a definir acciones precisas de conservación en L. flavigularis . Esta investigación es la base para definir la translocación de individuos entre las poblaciones, sin embargo, se requiere un estudio futuro más amplio que incorpore marcadores moleculares específicos para L. flavigularis. Asimismo, es necesario analizar las barreras que limitan el flujo genético, ya que es urgente reducir la diferenciación genética entre poblaciones e incrementar la diversidad genética de esta especie.

Resumen en inglés

Lepus flavigularis, is an endemic and endangered species, with only four populations inhabiting Oaxaca, México: Montecillo Santa Cruz, Aguachil, San Francisco del Mar Viejo and Santa María del Mar. Nevertheless, human activities like poaching and land use changes, and the low genetic diversity detected with mitochondrial DNA and allozymes in previous studies, have supported the urgent need of management strategies for this species, and suggest the definition of management units. For this, it is necessary to study the genetic structure with nuclear genes, due to their inheritance and high polymorphism, therefore, the objective of this study was to examine the variation and genetic structure of L. flavigularis using nuclear microsatellites. We sampled four populations of L. flavigularis and a total of 67 jackrabbits were captured by night sampling during the period of 2001 to 2006. We obtained the genomic DNA by the phenol-chloroform-isoamyl alcohol method. To obtain the diversity and genetic structure, seven microsatellites were amplified using the Polymerase Chain Reaction (PCR); the amplifications were visualized through electrophoresis with 10 % polyacrylamide gels, dyed with ethidium bromide. Genetic diversity was determined using the software GenAlEx v. 6.4, and genetic structure was obtained with ARLEQUIN v. 3.1; null alleles were evaluated using the program Micro-Checker v.2.2.2.

Additionally, a Bayesian analysis was performed with software STRUCTURE v. 2.2.3., and the isolation by distance (IBD) was studied using the program PASSAGE v.2.0.11.6. Our results showed that the genetic variation found was low (Hо = 0.30, HE = 0.24) when compared to other jackrabbit species. Fixed alleles and moderate levels of genetic differentiation (F ST = 0.18, P = 0.001) were detected among populations, indicating the effect of the genetic drift and limited gene flow. Bayesian clustering analysis revealed two groups: (1) jackrabbits from Montecillo Santa Cruz, and (2) individuals living in Aguachil, San Francisco del Mar Viejo and Santa María del Mar. No evidence was found of isolation by distance. It is possible that the geographic barriers present between populations (e . g . lagoons, human settlements), rather than the geographical distance between them, may explain the observed genetic structure. The inbreeding coefficient was negative (F IS = -0.27, P = 0.03), indicating genetic sub-structure in populations. We suggest two management units based on the genetically closer populations, which will help define precise conservation actions in L. flavigularis. This research is the basis for defining translocation of individuals between populations, nevertheless, a more extensive future study, with specific molecular markers for L. flavigularis, is required. In addition, it is necessary to analyze the barriers that limit the gene flow, since it is urgent to reduce the genetic differentiation between populations and increase the genetic diversity of this species.


2.
- Capítulo de libro con arbitraje
Extinción de la liebre de Tehuantepec
Lorenzo Monterrubio, Consuelo (autora) ;
Contenido en: La biodiversidad en Chiapas: estudio de estado / coordinación, edición y seguimiento general: Andrea Cruz Angón, Erika Daniela Melgarejo, Fernando Camacho Rico, Karla Carolina Nájera Cordero Distrito Federal, México : Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad : Gobierno del Estado de Chiapas, 2013 Vol. 2, p. 362-365 ISBN:978-607-8328-00-0
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SIBE Campeche
53102-40 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Chetumal
53102-30 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE San Cristóbal
53102-10 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Tapachula
53102-20 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Villahermosa
53102-50 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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3.
- Artículo con arbitraje
*En hemeroteca, SIBE-San Cristóbal
Diferenciación poblacional en la talla corporal de la liebre de Tehuantepec (Lepus flavigularis)
Rico Mancebo del Castillo, Yessica ; Lorenzo Monterrubio, Consuelo (coaut.) ; López Mendoza, Sergio (coaut.) ;
Contenido en: Acta Zoólogica Mexicana Nueva serie, Vol. 14, no. 3 (diciembre 2008), p. 179-189 ISSN: 0065-1737
Bibliotecas: San Cristóbal
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SIBE San Cristóbal
46971-10 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Nota: En hemeroteca, SIBE-San Cristóbal
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Resumen en: Español | Inglés |
Resumen en español

En este trabajo se analizaron las diferencias en la talla corporal de tres poblaciones de la liebre deTehuantepec, Lepus flavigularis, en el Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, México. Los análisis de regresiónlinear entre la longitud total del cuerpo y el peso corporal fueron estadísticamente significativos para lashembras y machos de la población de Santa María del Mar, y para los machos de la población deMontecillo Santa Cruz, pero no para las hembras. Asimismo, la relación no fue significativa para losmachos de Aguachil. El análisis de varianza indicó que las liebres de Santa María del Mar tienen mayorlongitud corporal que las liebres de Aguachil y Montecillo Santa Cruz. Los resultados encontradoscoincidieron con los datos genéticos que separan a las liebres de Santa María del Mar en un grupodistinto del resto de las poblaciones. Es posible que las diferencias en la longitud corporal esténrelacionadas con las características ecológicas del hábitat que predominan en cada una de laspoblaciones de liebres.

Resumen en inglés

In this work we analyzed the body size differentiation of three populations of the Tehuantepecjackrabbit, Lepus flavigularis, in the Isthmus of Tehuantepec, Oaxaca, Mexico. Linear regressionanalysis between body size and body weight were statistically significant for the males and femalesfrom the population of Santa María del Mar, and for the males from Montecillo Santa Cruz, but not forthe females. In addition, the regression analysis for the males of Aguachil was not significant. TheANOVA analysis revealed that jackrabbits from Santa María del Mar were statistically significant largerthan the jackrabbits from Aguachil and Montecillo Santa Cruz. The results were coincident with thegenetic data that highlight the genetic differentiation of Santa María del Mar of the rest of populations.It is possible that the differences in body size are related with the ecological characteristics of the habitatprevailing in each population of jackrabbits.


4.
- Artículo con arbitraje
Phylogeography and population structure of the endangered Tehuantepec jackrabbit Lepus flavigularis: implications for conservation
Rico Mancebo del Castillo, Yessica ; Lorenzo Monterrubio, Consuelo (coaut.) ; González Cózatl, Francisco Xavier (coaut.) ; Espinoza Medinilla, Eduardo E. (coaut.) ;
Clasificación: AR/599.3280972 / P4
Contenido en: Conservation Genetics Vol. 9, no. 6 (December 2008), p. 1467–1477 ISSN: 1566-0621
Bibliotecas: San Cristóbal
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SIBE San Cristóbal
ECO010014711 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Resumen en: Inglés |
Resumen en inglés

The Tehuantepec jackrabbit (Lepus flavigularis) is an endangered species restricted to a small area in the Isthmus of Tehuantepec, Oaxaca, Mexico. To evaluate its phylogeographic structure, population genetics, and demographic history we sequenced the mitochondrial Control Region hypervariable domain (CR-1) for 42 individuals representing the entire species range. Phylogenetic patterns indicated that this species is subdivided into two highly divergent clades, with an average nucleotide genetic distance of 3.7% (TrN) between them. Clades A and B are geographically distributed in non-overlapping areas to the west and to the east of the Isthmus of Tehuantepec, respectively. Genetic diversity indices showed reduced genetic variability in L. flavigularis when compared to other species of Lepus within main clades and within populations. This low genetic diversity coupled with the restricted distribution to very small areas of occurrence and limited gene flow suggest that genetic drift has played an important role in the evolution of this species. Historical demographic analysis also pointed out that these two clades underwent a recent population expansion that started about 9,000 years ago for clade A and 3,200 years ago for clade B during the Holocene. Consequently, from the conservation perspective our results suggest that populations included in clades A and B should be regarded as distinct evolutionary lineages.


5.
Tesis - Maestría
Variación genética nuclear de Lepus flavigularis (Mammalia: lagomorpha). Implicaciones para su conservación / Bárbara Cruz Salazar
Cruz Salazar, Bárbara (autora) ; Lorenzo Monterrubio, Consuelo (tutora) ; Maldonado Martínez, Jesús Eduardo (asesor) ; Espinoza Medinilla, Eduardo E. (asesor) ; López Mendoza, Sergio (asesor) ;
San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, México : El Colegio de la Frontera Sur , 2008
Disponible en línea
Clasificación: TE/599.328097 / C7
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SIBE Campeche
ECO040003275 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Chetumal
ECO030004573 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE San Cristóbal
ECO010012912 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Tapachula
ECO020012030 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Villahermosa
ECO050003291 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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Índice | Resumen en: Español |
Resumen en español

La fragmentación y modificación del hábitat de la liebre de Tehuantepec, Lepus flavigularis ha provocado la reducción de su distribución original a cuatro poblaciones (Santa María del Mar, Montecillo Santa Cruz, San Francisco del Mar Viejo y Aguachil) localizadas en los alrededores del Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, México. A través de datos moleculares, utilizando siete diferentes microsatélites y tres enzimas de restricción, se analizó la estructura y variabilidad genética de las cuatro poblaciones de liebres. La población de liebres con mayor variabilidad genética fue Montecillo Santa Cruz y la de menor variabilidad genética fue San Francisco del Mar Viejo con ambos métodos. El coeficiente de endogamia muestra exceso de heterocigotos y existen altos niveles de diferenciación genética entre las poblaciones de liebres. Las distancias genéticas indican mayor similitud genética entre las liebres de poblaciones cercanas geográficamente, San Francisco del Mar Viejo y Aguachil. Montecillo Santa Cruz y Santa María son las poblaciones con menor diferenciación genética a pesar de la distancia geográfica que las separa, siendo también las más variables genéticamente. Una acción de manejo específica para la conservación de L. flavigularis debe considerar traslocar gradualmente individuos dentro y entre dos unidades de manejo correspondientes a las poblaciones más similares genéticamente, la primera, las poblaciones de Montecillo Santa Cruz y Santa María del Mar, y la segunda, las poblaciones de San Francisco del Mar Viejo y Aguachil . Es igualmente importante monitorear a corto y largo plazo la pérdida o ganancia de alelos en cada población a partir de las traslocaciones propuestas y correlacionar los datos moleculares con datos demográficos, ecológicos y reproductivos en todas las poblaciones de la liebre de Tehuantepec para asegurar un plan adecuado de manejo.

Índice

Resumen
Introducción
Variabilidad genética
Antecedentes
Justificación
Objetivos
General
Particulares
Hipótesis
Método
Localización del área de estudio
Trabajo de campo
Trabajo de laboratorio
Análisis de datos y análisis estadísticos
Resultados
Enzimas de restricción (RFLP)
Microsatélites
Discusión y Conclusión
Acciones de Conservación
Literatura Citada


6.
- Artículo de divulgación
*En hemeroteca, SIBE-Campeche, SIBE-Chetumal, SIBE-San Cristóbal, SIBE-Tapachula, SIBE-Villahermosa
Una liebre única en el mundo
Lorenzo Monterrubio, Consuelo ;
Contenido en: ECOfronteras No. 29 (diciembre 2006), p. 13-14
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SIBE Campeche
45388-40 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Chetumal
45388-30 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE San Cristóbal
45388-10 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Tapachula
45388-20 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Villahermosa
45388-50 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Nota: En hemeroteca, SIBE-Campeche, SIBE-Chetumal, SIBE-San Cristóbal, SIBE-Tapachula, SIBE-Villahermosa
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