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26 resultados encontrados para: AUTOR: Calixto Romo, María de los Ángeles
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1.
- Artículo de divulgación
Las enzimas y la vida
Herrera López, David ; Calixto Romo, María de los Ángeles (coaut.) ;
Disponible en línea
Contenido en: ECOfronteras Vol. 23, no. 67 (septiembre/diciembre 2019), p. 6-8 ISSN: 2007-4549
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27919-60 (Disponible)
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Resumen en español

Las enzimas son moléculas sustantivas en nuestra vida y casi nadie lo sabe. Sin ellas sería imposible digerir, respirar y movernos, o consumir alimentos como leche y queso; además tienen aplicaciones medicinales y para reducir efectos contaminantes. Como punto medular, son la base de la actividad celular, lo que las hace indispensables, ya que todos los seres vivos están formados por células. ¿Las conoces?


2.
Tesis - Doctorado
Evaluación de la degradación de fármacos por una lacasa de Pleurotus djamor inmovilizada sobre Nylo-6 / Rosbi Cruz Ornelas
Cruz Ornelas, Rosbi (autora) ; Calixto Romo, María de los Ángeles (directora) ; Amaya Delgado, Lorena (asesora) ; Guillén Navarro, Griselda Karina (asesora) ; Sánchez, José E. (asesor) ;
Tapachula, Chiapas, México : El Colegio de la Frontera Sur , 2019
Clasificación: TE/579.6163 / C7
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ECO020013859 (Disponible)
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Resumen en español

Debido a su alta producción y consumo, los compuestos farmacéuticamente activos se encuentran en los cuerpos de agua formando mezclas complejas que pueden ejercer efectos tóxicos sobre algunas poblaciones de los organismos acuáticos. Esta contaminación ambiental ha evidenciado la necesidad de desarrollar diferentes técnicas para la eliminación de dichos fármacos. El objetivo de esta investigación fue evaluar la capacidad del hongo Pleurotus djamor (ECS-0123) en la degradación de antiflamatorios no esteroideos (AINEs) tales como diclofenaco, naproxeno y ketoprofeno. Primeramente, se realizaron cinéticas de degradación utilizando extractos crudos enzimáticos en el cual se evaluaron las actividades enzimáticas de lacasas, manganeso peroxidasas y lignino peroxidasas. Posteriormente se produjo, purificó e inmovilizó la enzima lacasa covalententemente sobre microesferas de Nylon-6. Se efectuó la caracterización bioquímica de las lacasas libres e inmovilizadas. Finalmente se evaluó la capacidad del biocatalizador sobre la mezcla de AINEs seleccionados. Se alcanzó la degradación de 90 % de diclofenaco en las primeras 6 h y el 80 % de degradación del ketoprofeno y naproxeno a las 48 h. Por otro lado, se monitoreó la presencia de las tres enzimas ligninoliticas (lacasas, manganeso peroxidasa y lignino peroxidasa) en P. djamor, las cuales incrementaron su actividad catalítica durante la degradación de mezcla de fármacos. Se lograron extractos de alta pureza de lacasa con un peso molecular de 41 kDa, con una mayor actividad catalítica a pH de 2.6 y una temperatura de 60 °C cuando se encontraba la enzima libre, mientras que inmovilizada presentó pH óptimo de 2 y 4.5, con temperatura óptima de 30 °C en los dos pH. Por último, se evaluó la capacidad del biocatalizador sobre la degradación de la mezcla de AINEs y se alcanzó una degradación mayor de 50 % durante las primeras 24 h.

Índice

Resumen
Capítulo I.- Introducción
Capítulo II.- Biodegradation of NSAIDs and their effect on the activity of ligninolytic enzymes from Pleurotus djamor
Capítulo III.- Degradación de Antiinflamatorios no esteroideos mediante lacasas de Pleurotus djamor inmovilizadas sobre microesferas de Nylon-6
Capitulo IV.- Conclusiones
Literatura citada


3.
Artículo
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An approach of anomaly detection and neural network classifiers to measure cellulolytic activity
Barbosa Santillán, Luis Fracisco ; Calixto Romo, María de los Ángeles (coaut.) ; Sánchez Escobar, Juan Jaime (coaut.) ; Barbosa Santillán, Liliana Ibeth (coaut.) ;
Contenido en: Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening Vol. 21, no. 9 (2018), p. 1-12 ISSN: 1875-5402
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Resumen en inglés

Abstract: Aim and Objective: A common method used for massive detection of cellulolytic microorganisms is based on the formation of halos on solid medium. However, this is a subjective method and real-time monitoring is not possible. The objective of this work was to develop a method of computational analysis of the visual patterns created by cellulolytic activity through artificial neural networks description. Materials and Methods: Our method learns by an adaptive prediction model and automatically determines when enzymatic activity on a chromogenic indicator such as the hydrolysis halo occurs. To achieve this goal, we generated a data library with absorbance readings and RGB values of enzymatic hydrolysis, obtained by spectrophotometry and a prototype camera-based equipment (Enzyme Vision), respectively. We used the first part of the library to generate a linear regression model, which was able to predict theoretical absorbances using the RGB color patterns, which agreed with values obtained by spectrophotometry. The second part was used to train, validate, and test the neural network model in order to predict cellulolytic activity based on color patterns. Results: As a result of our model, we were able to establish six new descriptors useful for the prediction of the temporal changes in the enzymatic activity. Finally, our model was evaluated on one halo from cellulolytic microorganisms, achieving the regional classification of the generated halo in three of the six classes learned by our model. Conclusion: We assume that our approach can be a viable alternative for high throughput screening of enzymatic activity in real time.


4.
- Artículo con arbitraje
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Resumen en español

El objetivo de este estudio fue aislar, seleccionar y caracterizar bacterias con actividad celulolítica a partir de 2 diferentes pilas de compostaje de residuos de café, una con temperatura interna de 57°C y pH 5,5; la otra con temperatura interna de 61°C y pH 9,3. Se utilizaron medios de cultivo con carboximetilcelulosa y celulosa cristalina como únicas fuentes de carbono. La actividad enzimática fue evaluada por formación de halos de hidrólisis, producción de azúcares reductores y zimogramas. De 20 cepas aisladas, 3 presentaron mayor actividad enzimática y fueron identificadas como Bacillus subtilis sobre la base de sus características morfológicas, fisiológicas y bioquímicas y del análisis de las secuencias de la región 16S del ADNr. Los extractos enzimáticos de las 3 cepas seleccionadas presentaron actividad de exocelulasa y de endocelulasa, con máximos de 0,254 y 0,519U/ml, respectivamente; la actividad de estas enzimas se mantuvo incluso a pH ácido (4,8) o básico (9,3) y a temperaturas de hasta 60°C. Las actividades enzimáticas halladas en este estudio se ubican dentro de las más altas reportadas para celulasas producidas por bacterias del género Bacillus. En los zimogramas se demostró actividad de endocelulasa desde las 24h hasta las 144h de incubación. Asimismo, se reporta por primera vez el efecto del pH sobre la actividad de endocelulasa observado por zimogramas. Los resultados de este estudio abren la posibilidad de hacer uso de estas enzimas en la obtención de sustratos fermentables para la producción de energía a partir de los residuos generados en grandes cantidades por la agroindustria del café.

Resumen en inglés

The goal of this study was to isolate, select and characterize bacteria with cellulolytic activity from two different coffee residue composting piles, one of which had an internal temperature of 57°C and pH 5.5 and the other, a temperature of 61°C, and pH 9.3. Culture media were manipulated with carboxymethylcellulose and crystalline cellulose as sole carbon sources. The enzyme activity was assessed by hydrolysis halo formation, reducing sugar production and zymograms. Three out of twenty isolated strains showed higher enzymatic activity and were identified as Bacillus subtilis according to their morphological, physiological, biochemical characteristics and based on the sequence analysis of 16S rDNA regions. The enzymatic extracts of the three selected strains showed exocellulase and endocellulase maximum activity of 0.254 and 0.519 U/ml, respectively; the activity of these enzymes was maintained even in acid pH (4.8) and basic (9.3) and at temperatures of up to 60°C. The enzymatic activities observed in this study are within the highest reported for cellulose produced by bacteria of the genus Bacillus. Endocellulase activity was shown in the zymograms from 24h until 144h of incubation. Furthermore, the pH effect on the endocellulase activity is reported for the first time by zymograms. The findings in this study entail the possibility to use these enzymes in the procurement of fermentable substrates for the production of energy from the large amount of residues generated by the coffee agroindustry.


5.
- Artículo con arbitraje
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Enzymatic dynamics into the Eisenia fetida (Savigny, 1826) gut during vermicomposting of coffee husk and market waste in a tropical environment
Ordoñez Arévalo, Flor Berenice ; Guillén Navarro, Griselda Karina (coaut.) ; Huerta Lwanga, Esperanza (coaut.) ; Cuevas González, Raúl (coaut.) ; Calixto Romo, María de los Ángeles (coaut.) ;
Contenido en: Environmental Science and Pollution Research Vol. 25, no. 2 (January 2018), p. 1576–1586 ISSN: 0944-1344
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Resumen en inglés

Epigeic worms modify microbial communities through their digestive processes, thereby influencing the decomposition of organic matter in vermicomposting systems. Nevertheless, the enzyme dynamics within the gut of tropically adapted earthworms is unknown, and the enzymes involved have not been simultaneously studied. The activities of 19 hydrolytic enzymes within three different sections of the intestine of Eisenia fetida were determined over a fasting period and at 24 h and 30, 60, and 90 days of vermicomposting, and data were evaluated by multivariate analyses. There were found positive correlations between the maximal activity of glycosyl hydrolases and one esterase with the anterior intestine (coincident with the reduction of hemicellulose in the substrate) and the activity of the protease α-chymotrypsin with posterior intestine. The results suggest that activities of enzymes change in a coordinated manner within each gut section, probably influenced by selective microbial enzyme enrichment and by the availability of nutrients throughout vermicomposting.


6.
- Tesis
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Predicción de la actividad enzimática en tiempo real usando redes neuronales / Luis Fracisco Barbosa Santillán
Barbosa Santillán, Luis Fracisco ; Barbosa Santillán, Liliana Ibeth (director) ; Calixto Romo, María de los Ángeles (codirector) ;
Guadalajara, Jalisco, México : Universidad de Guadalajara. Programa Académico de Posgrado , 2018
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Resumen en español

Un método común utilizado para la detección masiva de microorganismos celulolíticos se basa en la formación de halos en un medio sólido. Sin embargo, este es un método subjetivo y el monitoreo en tiempo real no es posible. El objetivo de este trabajo fue desarrollar un método de análisis computacional de los patrones visuales creados por la actividad celulolítica a través de la descripción de redes neuronales artificiales. El método aprende mediante un modelo de predicción adaptativa y determina automáticamente cuándo ocurre la actividad enzimática en un indicador cromogénico como el halo de hidrólisis. Para lograr este objetivo, se generó una biblioteca de datos con lecturas de absorbancia y valores RGB de hidrólisis enzimática, obtenidos por espectrofotometría y un equipo prototipo basado en cámara de video (Enzyme Vision), respectivamente. Se uso la primera parte de la biblioteca para generar un modelo de regresión lineal, que fue capaz de predecir las absorbancias teóricas utilizando los patrones de color RGB, que coincidieron con los valores obtenidos por espectrofotometría.

La segunda parte se utilizó para entrenar, validar y probar el modelo de red neuronal para predecir la actividad celulolítica basada en patrones de color. Como resultado del modelo, se establecieron seis nuevos descriptores útiles para la predicción de la actividad enzimática en tiempo real. El modelo fue evaluado sobre halos de microorganismos celulolíticos, logrando la clasificación regional del halo. Finalmente, como el modelo fue implementado en un microprocesador FPGA paralelo diseñado a la medida y dado que se logro una aceleración suficiente para capturar y analizar las 24 imágenes por segundo, generadas durante una agravación en vídeo de la evolución de la actividad enzimática, se concluye que este enfoque puede ser una alternativa viable para los ensayos masivos que se presentan en pruebas del tipo High-Throughput Screening (HTS).


7.
Tesis - Maestría
Capacidad de los hongos de pudrición blanca para degradar el metamizol sódico / Rosario Mayorga Santis
Mayorga Santis, Rosario (autora) ; Sánchez, José E. (director) ; Gutiérrez Hernández, Rubén Fernando (co-director) ; Calixto Romo, María de los Ángeles (asesora) ;
Tapachula, Chiapas, México : El Colegio de la Frontera Sur , 2017
Clasificación: TE/628.5 / M3
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Índice | Resumen en: Español |
Resumen en español

La fabricación de una amplia gama de productos farmacéuticos como son los analgésicos, los antidepresivos, los antiinflamatorios y los antibióticos para satisfacer las necesidades de salud en nuestra sociedad van en aumento (Yongjun et al., 2008; Miceli et al., 2014; He et al., 2016). La problemática ambiental de estos productos radica en el manejo inadecuado de los sobrantes que no se alcanzan a consumir o bien que llegan a caducar. La fuente principal que libera a estos contaminantes al ambiente es el agua que descargan las industrias farmacéuticas, hospitales y zonas domésticas (Ternes et al., 2006; Gomez et al., 2007; Kosjek et al., 2007; Quesada et al., 2009). Dependiendo de las propiedades físico-químicas de los fármacos, estos pueden llegar a alcanzar las aguas subterráneas y contaminarlas o bien quedar retenidas en el suelo y acumularse, pudiendo afectar la vida acuática y a los humanos a través de la cadena trófica (Andreozzi et al., 2002; Nash et al., 2004; Fent et al., 2006; Barceló y López, 2007; Schäfers et al., 2007; Gómez, 2011; Watanabe et al. 2012). Esta persistencia y toxicidad en medios acuosos, además de que no se encuentran regulados por ninguna normatividad, ha llevado a considerar a dichos compuestos como Contaminantes Emergentes (CE) (Arrieta y Guerra, 2012) Existe evidencia de que dichos contaminantes producen impactos como: errores en la muda, eclosión, deformidades anatómicas, cambios subletales en el crecimiento de las plantas, cambios en la proporción sexual de los organismos superiores, modificaciones en los ciclos biogeoquímicos y transmisión de genes de resistencia a antibióticos, variación en el ritmo de vida, reducción en la fertilidad, cambio de la condición sexual por hormonas, efectos tóxicos reproductivos y la muerte (Stuart et al., 2012)

Índice

I. Introducción
II. Artículo enviado: Degradation of sodium metamizole by enzymatic extracts from some white rot fungi
III. Conclusiones
IV. Literatura citada


8.
Tesis - Doctorado
Caracterización de bacterias y enzimas celulolíticas del compostaje con residuos de café / Hermila Yadira Siu Rodas
Siu Rodas, Hermila Yadira (autora) ; Calixto Romo, María de los Ángeles (directora) ; Guillén Navarro, Griselda Karina (asesora) ; Sánchez, José E. (asesor) ; Amaya Delgado, Lorena (asesora) ;
Tapachula, Chiapas, México : El Colegio de la Frontera Sur , 2017
Disponible en línea
Clasificación: TE/579.362097275 / S5
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ECO020013698 (Disponible)
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Índice | Resumen en: Español |
Resumen en español

Se realizó el aislamiento e identificación de bacterias celulolíticas en la fase termofílica de pilas de compostaje con residuos de café. Se utilizaron medios de cultivo con carboximetilcelulosa y celulosa cristalina como única fuente de carbono. De 20 cepas aisladas, A-SRETCR, M-SRETCR y N-SRETCR presentaron mayor actividad celulolítica, evaluada por formación de halos de hidrólisis, producción de azúcares reductores y zimogramas. Estas cepas fueron identificadas como Bacillus subtilis mediante características morfológicas, fisiológicas, bioquímicas y análisis de secuencia 16S rDNA. Los extractos enzimáticos de las tres cepas presentaron actividad endocelulasa y exocelulasa hasta de 0.519 y 0.254 U/ml respectivamente. Los extractos proteicos crudos de las cepas A-SRETCR y M-SRETCR, presentaron actividad endocelulasa desde las 24 hasta las 144 h de cultivo, evaluada en zimogramas que revelaron más de dos bandas de actividad con tamaño aproximado de 46, 55 y 176 kDa. Se purificaron parcialmente las CMCasas del extracto proteico de B. subtilis M-SRETCR, mediante precipitación con etanol e isoelectroenfoque; resultaron con punto isoeléctrico de 2.5, y con la mayor actividad a pH 5.5 y 8.0 a 55 ºC.

El análisis molecular reveló tres secuencias de celulasas con diferentes sitios de restricción AluI, con similitudes de 94 y 96 % con endocelulasas de diferentes cepas de B. subtilis y 62 % de identidad con secuencias péptido señal. Estas características sugieren que estas enzimas son diferentes a las reportadas por otros autores y entre sí. Así mismo, evidencian que M-SRETCR, posee más de dos celulasas, ubicándolo dentro de las pocas especies del género Bacillus que poseen dos o tres celulasas. Los resultados obtenidos en este estudio abren la posibilidad de hacer uso de estas enzimas, en la obtención de sustratos fermentables para la producción de energía a partir de los residuos generados en grandes cantidades por la agroindustria de café.

Índice

Resumen
Capítulo I. Introducción
Capítulo II. Bacillus subtilis with endocellulase and exocellulase activities isolated in the thermophilic phase from composting with coffee residues
Capítulo III. Biochemical and molecular characterization of CMCases of Bacillus subtilis M-SRETCR
Capítulo IV. Conclusiones
Literatura citada
Anexo. Estrategia de clonación de gen de celulasa


9.
- Artículo con arbitraje
Cellulases and xylanases production by Penicillium citrinum CGETCR using coffee pulp in solid state fermentation
Peña Maravilla, Miriam ; Calixto Romo, María de los Ángeles (coaut.) ; Guillén Navarro, Griselda Karina (coaut.) ; Sánchez, José E. (coaut.) ; Amaya Delgado, Lorena (coaut.) ;
Contenido en: Revista Mexicana de Ingeniería Química Vol. 16, no. 3 (September-December 2017), p. 757-769 ISSN: 2395-8472
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Resumen en español

Este trabajo reporta, por primera vez, el uso de residuos de pulpa de café para la expresión de enzimas celulolíticas y xilanolíticas por el hongo nativo Penicillium citrinum cepa CGETCR por fermentación en estado sólido. El café es una de las bebidas más importantes a nivel mundial produciendo diversos residuos como la pulpa de café, la cual es considerada un contaminante, si no se trata adecuadamente. Se ha demostrado que este residuo causa daños en la fauna de los ríos ya que contiene taninos, cafeína (1-4%), alto contenido de polifenoles, presencia de ocratoxina A y una alta acidez (pH 3.5). Por estos motivos, se realizó un estudio sobre el aprovechamiento de estos residuos para obtener productos de alto valor agregado como son enzimas de interés biotecnológico. La expresión enzimática fue optimizada usando la metodología de superficie de respuesta mediante un diseño central compuesto para estudiar el pH, humedad y tiempo de fermentación teniendo como variable de respuesta la actividad endoglucanasa. Las actividades enzimáticas encontradas fueron -glucosidasas, endoglucanasas, exoglucanasas y xilanasas las cuales fueron capaces de funcionar bajo condiciones de acidez (4.0-5.5) y basicidad (7.5-8.0). Adicionalmente, el extracto enzimático se usó sobre residuos agroindustriales para evaluar la producción de azúcares simples.

Resumen en inglés

This work reports, for the first time, the use of coffee pulp residue to the expression of cellulolytic and xylanolytic enzymes by the native fungus Penicillium citrinum strain CGETCR by solid-state fermentation (SSF). Coffee is one of the most important drinks in the world producing several residues such as coffee pulp, which is considered a contaminant if not properly disposed. This residue cause damage to the fauna from rivers due to its composition including tannins, pH 3.5, (1-4%) caffeine, polyphenolic compound, ochratoxin A, the presence of the latter three have toxic or nephrotoxic effects on higher animals. For these reasons, a study on the use of these residues to obtain high-added value products as enzymes of biotechnological interest, was performed. Enzyme production study process was optimized using the response surface method in a composite central design to study pH, moisture and fermentation time using endoglucanase activity as the response variable. The enzymatic activities found were β-glycosidases, endoglucanases, exoglucanases and xylanases which were able to function under acidic and basic conditions. Additionally, protein extract was used on agroindustrial residues to evaluate reducing sugar production.


10.
- Artículo con arbitraje
Degradation of sodium metamizole by enzymatic extracts from some white rot fungi
Mayorga Santis, Rosario ; Sánchez, José E. (coaut.) ; Gutiérrez Hernández, Rubén Fernando (coaut.) ; Calixto Romo, María de los Ángeles (coaut.) ;
Contenido en: Sydowia Vol. 69 (2017), p. 205–214 ISSN: 0082-0598
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Resumen en: Inglés |
Resumen en inglés

White rot fungi are known for their highly efficient ability to degrade environmental pollutants, such as pharmaceuticals. We investigated the ability of enzymatic extracts from Auricularia fuscosuccinea, Lentinula edodes, Ganoderma lucidum, Agrocybe aegerita, Pleurotus ostreatus, P. djamor and P. eryngii to degrade the analgesic drug metamizole. The formation of 4-MAA and 4-AA metabolites was also monitored. Total degradation of 50 mg l-1 of the drug was achieved with the extract obtained from A. fuscosuccinea ECS-210 within three days. Under the best conditions (pH 5.6, 35 °C and 110 rpm), the degradation profile followed the behavior of pseudo-first order kinetics with a coefficient k = 0.0779 L mg-1h-1. The enzymatic activity tests showed evidence for the presence of laccases, lignin peroxidases and phenoloxidases.