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1.
- Artículo con arbitraje
Genetic diversity in mexican wild populations of the great curassow (Crax rubra)
Morales Contreras, Jonathan ; Escalante Pliego, Patricia (coaut.) ; Matías Ferrer, Noemí (coaut.) ;
Contenido en: Biota Neotropica Vol. 19, no. 1, e20180649 (Jan 2019), p. 1-9 ISSN: 1806-129X
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Resumen en: Español | Inglés |
Resumen en español

El hocofaisán (Crax rubra) es un ave de la región Neotropical con amplia distribución, que se encuentra en diferentes categorías de riesgo, por la IUCN está catalogada como una especie Vulnerable. A nivel nacional, dentro de la NOM-059-SEMARNAT-2010 está considerada como una especie amenazada, y la subespecie Crax rubra griscomi restringida a la isla de Cozumel, está categorizada como en peligro de extinción. Entre los factores principales por los que se encuentra en grave riesgo, destacan la pérdida y fragmentación del hábitat, la cacería, la sobreexplotación, la extracción y el comercio ilegal. El objetivo del presente estudio es conocer la estructura y variación genética de la especie dentro de las poblaciones silvestres mexicanas de Crax rubra, mediante el uso de tres marcadores mitocondriales y uno nuclear (COI, ND2, Cyt b y MUSK). A partir de 47 muestras obtenidas mediante colecta no invasiva (plumas) que incluyen las dos fases de plumaje de la hembra: café oscura y barrada (rara en México). Se observó que el flujo génico entre las poblaciones remanentes es reciente y extenso, incluso entre las poblaciones continentales y la isleña (C. r. griscomi). Los resultados indican que las subespecies C. r. rubra y C. r. griscomi no presentan una marcada diferenciación genética dado que la segunda presentó un haplotipo exclusivo y uno compartido. Con el presente estudio brindamos la primera aproximación genético-geográfica del hocofaisán en México y una línea de base para futuros estudios, en el que se observa una diferenciación geográfica gradual entre las poblaciones del oeste y del este del Istmo de Tehuantepec. Finalmente, la información obtenida indica que en las poblaciones mexicanas del hocofaisán persiste una diversidad genética importante y que su conservación en los ecosistemas puede ser suficiente mediante la protección a la sobreexplotación, la conservación y restauración de su hábitat.

Resumen en inglés

The Great Curassow (Crax rubra) is a Neotropical bird with a wide distribution; it is classified under different threat categories and is listed as a vulnerable species by the IUCN. The Official Mexican Standard, the NOM-059-SEMARNAT-2010, indicates that the Great Curassow is a threatened species, and the subspecies Crax rubra griscomi, which is restricted to the island of Cozumel, is classified as critically endangered. Habitat loss and fragmentation, hunting, overexploitation, and illegal trade are among the main factors that have placed the bird at an endangered status. The objective of the present study was to determine the genetic structure and variation of the species within the Mexican populations of Crax rubra by using three mitochondrial markers, and one nuclear marker (COI, ND2, Cyt b, and MUSK). We used 47 samples obtained by noninvasive collection (feathers) including the two different color phases of the female plumage: dark brown and barred (rare in Mexico). Gene flow between the remaining populations is recent and extensive, even between the continental and the island population (C. r. griscomi). The results indicate that the subspecies C. r. rubra and C. r. griscomi do not present a marked genetic differentiation because the second exhibits an exclusive haplotype and a shared haplotype. With this study, we provide the first genetic-geographic approximation of the curassow in Mexico, where a gradual geographic differentiation is observed between the western and eastern populations of the Isthmus of Tehuantepec, and we provide a baseline for future studies. Finally, the information obtained indicates that important genetic diversity persists in the Mexican populations of the Great Curassow and that sufficient conservation within the ecosystems of these subspecies can be obtained by protecting them from overexploitation and by conserving and restoring their habitat.


2.
Tesis - Maestría
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Índice | Resumen en: Español | Inglés |
Resumen en español

El género Eugerres Jordan y Evermann, 1927 está representado por tres especies con distribución en el Pacífico oriental tropical: E. axillaris (Günther, 1864), E. brevimanus (Günther, 1864) y E. lineatus (Humboldt, 1821); otras tres especies distribuidas en el Atlántico occidental tropical: E. awlae (Schultz, 1949), E. brasilianus (Cuvier, 1830) y E. plumieri (Cuvier, 1830); y dos más, de ambientes dulceacuícolas del sureste de México y norte de Guatemala: E. mexicanus (Steindachner, 1869) y E. castroaguirrei González-Acosta y Rodiles-Hernández, 2013. Estudios filogenéticos sustentados en el análisis morfológicos, han demostrado que el género Eugerres es un grupo monofilético; dicha hipótesis fue contrastada en el presente estudio, utilizando información de tipo molecular. Para ello, se analizaron 61 secuencias genéticas de un segmento de gen mitocondrial (citocromo c oxidasa subunidad 1, COI por sus siglas en inglés); siete de ellas obtenidas del Sistema de Código de Barras de la Vida (BOLD System) para las especies E. brasilianus y Eucinostomus currani Zahuranec, y 54 secuencias de ejemplares recolectados en campo que corresponden al resto de las especies que integran el grupo interno (Eugerres spp., con excepción de E. brevimanus) y dos grupos externos: Diapterus brevirostris (Ranzani, 1842) y Gerres cinereus Walbaum, 1792.

Con esta información, se generó una matriz de secuencias alineadas que fue utilizada para llevar las reconstrucciones filogenéticas del género Eugerres, aplicando los métodos de Máxima Parsimonia, Máxima Verosimilitud e Inferencia Bayesiana. Las topologías de los árboles resultantes permitió determinar que el género Eugerres constituye un grupo parafilético-polifilético, en donde el componente dulceacuícola manifiesta un origen evolutivo independiente con relación al grupo de especies de Eugerres con distribución en ambientes marino-estuarinos. A su vez, éstas últimas podrían reflejar una relación antigua entre las cuencas del Atlántico occidental y Pacífico oriental.

Resumen en inglés

The genus Eugerres Jordan and Evermann, 1927 is represented by three species with distribution in the tropical eastern Pacific: E. axillaris (Günther, 1864), E. brevimanus (Günther, 1864), and E. lineatus (Humboldt, 1821). Other three species distributed in the tropical western Atlantic: E. awlae (Schultz, 1949), E. brasilianus (Cuvier, 1830), and E. plumieri (Cuvier, 1830), plus two species in freshwater ecosystems of the southeastern Mexico and northern Guatemala: E. mexicanus (Steindachner, 1869) and E. castroaguirrei González-Acosta y Rodiles-Hernández, 2013. Phylogenetic studies based on morphological characters have confirmed the monophyly of the genus Eugerres. The hypothesis on the monophyly of this genus was tested using molecular data. We analyzed 61 genetic sequences from the cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) of mitochondrial gene segment, seven of them obtained from the life data barcode system (BOLD system) for E. brasilianus and Eucinostomus currani Zahuranec, 1980. Other 54 sequences from collected specimens in field belonging to included to the ingroup (Eugerres spp., with exception E. brevimanus) and those from de outgroup Diapterus brevimanus (Ranzani, 1842) and Gerres cinereus Walbaum, 1792 were also sequenced. A matrix of data was employed for the phylogenetic reconstruction of the genus Eugerres by using Maximum Parsimony, Maximum Likelihood, and Bayesian Inference methods. Based on the resulting topologies, we determined that the genus Eugerres is a paraphyletic-polyphyletic group, where the freshwater group showed an independent origin from the marine-estuarine Eugerres spp. The marine-estuarine species could reflect an ancient relationship between the eastern Pacific (E. axillaris and E. lineatus) and western Atlantic (E. awlae, E. plumieri and E. brasilianus) basins.

Índice

Lista de Figuras
Lista de Tablas
Glosario
Resumen
Abstract
Introducción
Antecedentes
Justificación
Hipótesis
Objetivo General
Objetivos Particulares
Material y Métodos
Obtención de muestras biológicas
Extracción de ADN, amplificación conducida por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación
Análisis de datos
Análisis de Máxima Parsimonia
Asignación de un modelo explícito de sustitución
Análisis de Máxima Verosimilitud
Análisis Bayesiano
Cálculo de distancias genéticas
Resultados
Análisis de Máxima Parsimonia
Análisis de Máxima Verosimilitud
Análisis de Inferencia Bayesiana
Cálculo de distancias genéticas
Análisis filogenéticos sin incluir al componente dulceacuícola (E. castroaguirrei + E. mexicanus) como parte del género Eugerres
Análisis de Máxima Parsimonia (sin incluir al componente dulceacuícola del género Eugerres)
Análisis de Máxima Verosimilitud (sin incluir al componente dulceacuícola del género Eugerres)
Análisis de Inferencia Bayesiana (sin incluir al componente dulceacuícola del género Eugerres)
Discusión
Conclusiones
Literatura Citada

Anexos
Anexo 1. Datos de identificación, recolecta y colección de depósito de los ejemplares recolectados (Diapterus brevirostris, Eugerres awlae, Eugerres axillaris, Eugerres castroaguirrei, Eugerres lineatus, Eugerres mexicanus, Eugerres plumieri y Gerres cinereus) y de aquellos depositados en el Sistema de Códigos de Barras de la Vida (Eugerres brasilianus y Eucinostomus currani)
Anexo 2. Procedimiento seguido para la extracción de ADN mediante la técnica de fenol-cloroformo
Anexo 3. Protocolo del Centro Canadiense para la Amplificación del Código de Barras de la Vida (citocromo c oxidasa subunidad 1), desarrollado por Ivanova y Graninger (2006)
Anexo 4. Número de secuencias genéticas obtenidas a partir de un fragmento de genoma mitocondrial (COI), analizadas por especie del género Eugerres y grupos externos. Entre paréntesis, el acrónimo de la especie usado en todos los análisis
Anexo 5. Matriz de las secuencias genéticas (COI) utilizadas para generar los cladogramas a partir de los métodos de Parsimonia, Máxima Verosimilitud e Inferencia Bayesiana


3.
Artículo
*En hemeroteca, SIBE-San Cristóbal
New bird records for Cozumel Island found in scientific collections
Macouzet, Tania (autora) ; Escalante Pliego, Patricia (autora) ;
Contenido en: Revista Mexicana de Biodiversidad Vol. 84, no. 1 (marzo 2013), p. 392-396 ISSN: 1870-3453
Bibliotecas: San Cristóbal
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SIBE San Cristóbal
55752-10 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Nota: En hemeroteca, SIBE-San Cristóbal
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Resumen en: Español | Inglés |
Resumen en español

Se encontraron 4 nuevos registros de especies de aves para la Isla Cozumel obtenidos a través del análisis de un compendio de registros de ejemplares de aves depositados en los museos del mundo, Atlas de las Aves de México. Las especies encontradas fueron Empidonax alnorum (mosquero ailero), Vireo solitarius (vireo cabeza azul), Catharus fuscescens (zorzal rojizo) y Zonotrichia leucophrys (gorrión corona blanca). Para estas especies no se tenían registros en la Isla Cozumel aunque se consideran migratorias “de paso” en el área de la península de Yucatán.

Resumen en inglés

We report here 4 new bird records found among a large-scale compilation of specimen records in museums worldwide, Atlas de las Aves de Mexico. The new records are for 4 migratory species, Empidonax alnorum (Alder Flycatcher), Vireo solitarius (Solitary Vireo), Catharus fuscescens (Veery), and Zonotrichia leucophrys (Whitecrowned Sparrow). These species are not to-date known from Cozumel, although they are considered transients in the Yucatán Peninsula.


4.
- Capítulo de libro sin arbitraje
*Solicítelo con su bibliotecario/a
Isla Cozumel
Maucouzat Fuentes, Tania Marcela (autora) ; Escalante Pliego, Patricia (autora) ; Martínez Morales, Miguel Ángel (autor) (-2020) ; Pozo, Carmen (autora) ; De Alba Bocanegra, Alejandro (autor) ;
Contenido en: Áreas de importancia para la conservación de las aves en México / editores: Ma. del Coro Arizmendi y Laura Márquez Valdelamar Distrito Federal, México : Ma. del Coro Arizmendi y Laura Márquez Valdelamar, [2000] p. 333-334 ISBN:970-18-4319-3
Bibliotecas: Campeche , Chetumal , San Cristóbal
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SIBE Campeche
53975-30 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Chetumal
53975-20 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE San Cristóbal
53975-10 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Nota: Solicítelo con su bibliotecario/a

5.
Artículo
Insular biogeography of submontane humid forests in Mexico
Llorente Bousquets, Jorge E. ; Escalante Pliego, Patricia (coaut.) ;
Clasificación: AR CH/574.9097275 / L5
Contenido en: Biogeography of Mesoamerica No. 1, (1992), p. 139-146
Bibliotecas: San Cristóbal
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SIBE San Cristóbal
ECO010010882 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1

6.
Libro
Catálogo de aves: museo de zoología, Facultad de Ciencias. Universidad Nacional Autónoma de México / Adolfo Gerardo Navarro Siguenza; Mariam Gabriela Torres Chávez; Bertha Patricia Escalante Pliego
Navarro Sigüenza, Adolfo Gerardo ; Torres Chávez, Miriam Gabriela ; Escalante Pliego, Patricia ;
México : Universidad Nacional Autónoma de México. Facultad de Ciencias , 1991
Clasificación: C/598.2 / N3
Bibliotecas: Chetumal
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SIBE Chetumal
ECO030005928 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1

7.
Libro
Listado de nombres comunes de las aves de México / Patricia Escalante, Andrés M. Sada, Javier Robles Gil
Escalante Pliego, Patricia ; Sada, Andrés M. (coaut.) ; Robles Gil, Javier (coaut.) ;
México : Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad. Sierra Madre
Clasificación: C/598.2 / E8
Bibliotecas: Chetumal
Cerrar
SIBE Chetumal
ECO030005929 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1

8.
Libro