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1.
- Artículo con arbitraje
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Resumen en: Español | Inglés |
Resumen en español

El objetivo de este estudio fue aislar, seleccionar y caracterizar bacterias con actividad celulolítica a partir de 2 diferentes pilas de compostaje de residuos de café, una con temperatura interna de 57°C y pH 5,5; la otra con temperatura interna de 61°C y pH 9,3. Se utilizaron medios de cultivo con carboximetilcelulosa y celulosa cristalina como únicas fuentes de carbono. La actividad enzimática fue evaluada por formación de halos de hidrólisis, producción de azúcares reductores y zimogramas. De 20 cepas aisladas, 3 presentaron mayor actividad enzimática y fueron identificadas como Bacillus subtilis sobre la base de sus características morfológicas, fisiológicas y bioquímicas y del análisis de las secuencias de la región 16S del ADNr. Los extractos enzimáticos de las 3 cepas seleccionadas presentaron actividad de exocelulasa y de endocelulasa, con máximos de 0,254 y 0,519U/ml, respectivamente; la actividad de estas enzimas se mantuvo incluso a pH ácido (4,8) o básico (9,3) y a temperaturas de hasta 60°C. Las actividades enzimáticas halladas en este estudio se ubican dentro de las más altas reportadas para celulasas producidas por bacterias del género Bacillus. En los zimogramas se demostró actividad de endocelulasa desde las 24h hasta las 144h de incubación. Asimismo, se reporta por primera vez el efecto del pH sobre la actividad de endocelulasa observado por zimogramas. Los resultados de este estudio abren la posibilidad de hacer uso de estas enzimas en la obtención de sustratos fermentables para la producción de energía a partir de los residuos generados en grandes cantidades por la agroindustria del café.

Resumen en inglés

The goal of this study was to isolate, select and characterize bacteria with cellulolytic activity from two different coffee residue composting piles, one of which had an internal temperature of 57°C and pH 5.5 and the other, a temperature of 61°C, and pH 9.3. Culture media were manipulated with carboxymethylcellulose and crystalline cellulose as sole carbon sources. The enzyme activity was assessed by hydrolysis halo formation, reducing sugar production and zymograms. Three out of twenty isolated strains showed higher enzymatic activity and were identified as Bacillus subtilis according to their morphological, physiological, biochemical characteristics and based on the sequence analysis of 16S rDNA regions. The enzymatic extracts of the three selected strains showed exocellulase and endocellulase maximum activity of 0.254 and 0.519 U/ml, respectively; the activity of these enzymes was maintained even in acid pH (4.8) and basic (9.3) and at temperatures of up to 60°C. The enzymatic activities observed in this study are within the highest reported for cellulose produced by bacteria of the genus Bacillus. Endocellulase activity was shown in the zymograms from 24h until 144h of incubation. Furthermore, the pH effect on the endocellulase activity is reported for the first time by zymograms. The findings in this study entail the possibility to use these enzymes in the procurement of fermentable substrates for the production of energy from the large amount of residues generated by the coffee agroindustry.


2.
Tesis - Doctorado
Caracterización de bacterias y enzimas celulolíticas del compostaje con residuos de café / Hermila Yadira Siu Rodas
Siu Rodas, Hermila Yadira (autora) ; Calixto Romo, María de los Ángeles (directora) ; Guillén Navarro, Griselda Karina (asesora) ; Sánchez, José E. (asesor) ; Amaya Delgado, Lorena (asesora) ;
Tapachula, Chiapas, México : El Colegio de la Frontera Sur , 2017
Disponible en línea
Clasificación: TE/579.362097275 / S5
Bibliotecas: Tapachula
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SIBE Tapachula
ECO020013698 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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Índice | Resumen en: Español |
Resumen en español

Se realizó el aislamiento e identificación de bacterias celulolíticas en la fase termofílica de pilas de compostaje con residuos de café. Se utilizaron medios de cultivo con carboximetilcelulosa y celulosa cristalina como única fuente de carbono. De 20 cepas aisladas, A-SRETCR, M-SRETCR y N-SRETCR presentaron mayor actividad celulolítica, evaluada por formación de halos de hidrólisis, producción de azúcares reductores y zimogramas. Estas cepas fueron identificadas como Bacillus subtilis mediante características morfológicas, fisiológicas, bioquímicas y análisis de secuencia 16S rDNA. Los extractos enzimáticos de las tres cepas presentaron actividad endocelulasa y exocelulasa hasta de 0.519 y 0.254 U/ml respectivamente. Los extractos proteicos crudos de las cepas A-SRETCR y M-SRETCR, presentaron actividad endocelulasa desde las 24 hasta las 144 h de cultivo, evaluada en zimogramas que revelaron más de dos bandas de actividad con tamaño aproximado de 46, 55 y 176 kDa. Se purificaron parcialmente las CMCasas del extracto proteico de B. subtilis M-SRETCR, mediante precipitación con etanol e isoelectroenfoque; resultaron con punto isoeléctrico de 2.5, y con la mayor actividad a pH 5.5 y 8.0 a 55 ºC.

El análisis molecular reveló tres secuencias de celulasas con diferentes sitios de restricción AluI, con similitudes de 94 y 96 % con endocelulasas de diferentes cepas de B. subtilis y 62 % de identidad con secuencias péptido señal. Estas características sugieren que estas enzimas son diferentes a las reportadas por otros autores y entre sí. Así mismo, evidencian que M-SRETCR, posee más de dos celulasas, ubicándolo dentro de las pocas especies del género Bacillus que poseen dos o tres celulasas. Los resultados obtenidos en este estudio abren la posibilidad de hacer uso de estas enzimas, en la obtención de sustratos fermentables para la producción de energía a partir de los residuos generados en grandes cantidades por la agroindustria de café.

Índice

Resumen
Capítulo I. Introducción
Capítulo II. Bacillus subtilis with endocellulase and exocellulase activities isolated in the thermophilic phase from composting with coffee residues
Capítulo III. Biochemical and molecular characterization of CMCases of Bacillus subtilis M-SRETCR
Capítulo IV. Conclusiones
Literatura citada
Anexo. Estrategia de clonación de gen de celulasa


3.
Tesis - Licenciatura
Distribución del fósforo en un humedal artificial subsuperficial de flujo horizontal / Neidy Soledad González Méndez
González Méndez, Neidy Soledad ; Mejía González, Gamaliel (director) ; Herrera López, David (asesor) ; Siu Rodas, Hermila Yadira (asesora) ;
Tapachula, Chiapas, México : Universidad Autónoma de Chiapas. Instituto de Biociencias , 2015
Clasificación: TE/628.35 / G6
Bibliotecas: Tapachula
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SIBE Tapachula
ECO020013359 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Resumen en: Inglés |
Resumen en inglés

En el presente estudio se evaluó la distribución del fósforo (P) en los componentes (agua, soporte y plantas) de un Humedal Artificial Subsuperficial de Flujo Horizontal (HASFH), alimentado con agua residual (AR) del beneficio húmedo de café. Usando arena y grava como soporte y Saccharum officinarum como especie vegetal. El estudio se llevó a cabo durante un periodo de operación de 36 días. Se determinó Fósforo Total (PT) y Fósforo soluble (PS), además de parámetros como pH, Temperatura (T), conductividad eléctrica (CE), oxígeno disuelto (OD) y parámetros morfológicos como numero de hojas, diámetro de tallo, altura de la planta y presencia y/o ausencia de raíz. Los resultados indicaron que la arena de rio como medio de soporte es más eficiente en la remoción del P en comparación con la grava. Así mismo, Saccharum officinarum no tuvo una participación en la absorción de P, siendo mayor la concentración de P al inicio y menor al final del experimento.


4.
Tesis
Resumen en español

Se evaluó la remoción de nitrógeno orgánico (N-NH2), amonio (N-NH4 +) y nitratos (NNO3 -) además, la presencia y cuantificaron de microorganismos nitrificantes y desnitrificantes, en un humedal artificial subsuperficial de flujo horizontal a escala piloto con dos tiempos de retención hidráulica (TRH) (6 y 12 días), alimentado con aguas residuales del beneficiado húmedo del café. Los resultados de porcentajes de remoción fueron: nitrógeno total por Kjeldhal (NTK) de 75 y 85 %, N-NH4 + 35 y 55% y N-NO3 - 100 y 50% en el TRH de 6 y 12 días respectivamente. Las concentraciones de NTK disminuyeron progresivamente desde la entrada hasta la salida, el N-NH4 +, se observó un ligero incremento en la primera parte del HA, sobre todo en el TRH6, indicando un proceso de amonificación. La determinación de nitratos presentó valores bajos, el cual se atribuye al proceso de nitrificación-desnitrificación. Aun cuando se demostró altos valores de remoción, los parámetros como pH, OD y ORP encontrados dentro del HA no fueron los óptimos, según la bibliografía, para llevar acabo una remoción completa. Una característica del HA fue el hecho de haber incrementado el pH sin adición de álcalis, teniendo valores promedio de entrada de 3.7 y en salida de 6.5 unidades. En cuanto a la cuantificación de microorganismos se obtuvo mayor crecimiento en medios de cultivo para bacterias nitrificantes durante los dos TRH (>2.4x105 NMP/100ml), en comparación con los medios de cultivo para bacterias desnitrificantes (Pseudomonas, Thiobacillus y Paracoccus con poblaciones de 2.4x105, 4.5x103 y 1.4x103 NMP/100ml respectivamente).

Índice

Resumen
Introducción
Materiales y Métodos
Muestreo
Evaluación de parámetros fisicoquímicos
Evaluación de parámetros microbiológicos
Resultados y Discusión
Conclusión
Referencias


5.
- Artículo con arbitraje
Heavy metals in wet method coffee processing wastewater in Soconusco, Chiapas, Mexico
Siu Rodas, Hermila Yadira ; Mejía González, Gamaliel (coaut.) ; Mejia Saavedra, J. (coaut.) ; Pohlan, Jurgen (coaut.) ; Sokolov Muratov, Mikhail Yurievich (coaut.) ;
Contenido en: Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology Vol. 78, no. 5 (may 2007), p. 400-404 ISSN: 0007-4861
Resumen en: Inglés |
Resumen en inglés

One of the driving forces of the economy in southeast Mexico is agriculture. In Soconusco, Chiapas, coffee is one of the main agricultural products and is traded on the international market. Coffee grown in this region is processed using the wet method in order to be commercialized as green coffee. In the beneficio (coffee processing plant) water is an essential resource which is required in great quantities (Matuk et al., 1997; Sokolov, 2002) as it is used to separate good coffee berries from defective ones, as a method of transporting the coffee berries to the processing machinery, in the elimination of the berry husk from the coffee grains (pulping) and finally in the post-fermentation washing process. This process gives rise to one of the smoothest, high-quality coffees available (Zuluaga, 1989; Herrera, 2002).

Currently, many producers in Soconusco are opting for ecological coffee production, which has, among its many criteria, human health and environmental protection (Pohlan, 2005). Furthermore, increasing concern during the past few years regarding the production of food that is free from contaminants such as heavy metals, and recent environmental policies in relation to aquatic ecosystem protection, have given rise to questions concerning the quality of water used in coffee processing, as well as pollutants produced by this agroindustry. Water used in the coffee processing plants originates from the main regional rivers whose hydrological basins stretch from the Sierra Madre mountain range down to the coastal plain. As well as providing water, these rivers also receive the wastewater produced during coffee processing (Sokolov, 2002).


6.
Tesis - Maestría
Metales pesados en aguas del procesamiento húmedo de café y en ríos de la región del Soconusco, Chiapas / Hermila Yadira Siu Rodas
Siu Rodas, Hermila Yadira ; Sokolov Muratov, Mikhail Yurievich (tutor) ; Pohlan, Jurgen (asesor) ; Mejía Saavedra, José de Jesús (asesor) ; Ruiz García, Antonio Joel (asesor) ;
Tapachula, Chiapas, México : El Colegio de la Frontera Sur , 2006
Clasificación: TE/628.168097275 / S5
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SIBE Campeche
ECO040002734 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Chetumal
ECO030004218 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE San Cristóbal
ECO010006318 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Tapachula
ECO020009480 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Cerrar
SIBE Villahermosa
ECO050002927 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
Resumen en español

El café mexicano esta perdiendo mercado internacional, una de las alternativas para conservarlo es produciendo café orgánico y sustentable, que involucra el control de calidad del producto y del ambiente. Uno de los parámetros que exigen los compradores de este tipo de café es la ausencia de metales pesados en el agua que se utiliza en el beneficiado húmedo de café, así mismo las Normas Oficiales Mexicanas establecen límites máximos permisibles de metales en las agua residuales del beneficiado. En este estudio se evaluó por espectroscopia de absorción atómica la presencia de plomo (Pb), cobre (Cu), cadmio (Cd), manganeso (Mn), zinc (Zn), hierro (Fe), níquel (Ni) y arsénico (As) y se realizó una caracterización fisicoquímica mediante la medición de pH, conductividad, turbidez, oxígeno disuelto, cloruros, dureza, fósforo, nitratos y nitrógeno total en el agua utilizada para el procesamiento de café, el agua del proceso de despulpado y del sistema de descarga de tres beneficios húmedos de café de la región del Soconusco, Chiapas, y en los ríos Comaltitlán y Huehuetán que son los que abastecen de agua y a los que descargan directamente las agua residuales estos beneficios. Los resultados obtenidos muestran que el agua que se utiliza en el beneficiado húmedo de café contiene concentraciones traza de Pb, Cu, Cd, Zn y As, y altas concentraciones de Mn y Fe debido a la naturaleza de los ríos, los cuales son diferentes de acuerdo a las características fisicoquímicas. Los niveles de todos los metales pesados analizados se incrementaron en el proceso de despulpado y en la descarga así mismo los parámetros fisicoquímicos medidos a excepción del pH y el oxígeno disuelto que disminuyeron por el alto contenido de materia orgánica que se genera del proceso.

Índice

Resumen
Capitulo 1. Metales pesados en agua del procesamiento húmedo de café y en ríos de la región del Soconusco, Chiapas
I. Introducción
II. Objetivos
III. Metodología
IV. Resultados y Discusión
V. Conclusiones
VI. Bibliografía
VII. Anexos
Capitulo 2. Articulo enviado al Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology
Anexos


7.
Artículo
Efecto tóxico de DDT y endosulfan en postlarvas de camarón blanco, Litopenaeus vannamei (Decapoda: penaeidae) de Chiapas, México
Castro Castro, Vicente ; Siu Rodas, Hermila Yadira (coaut.) ; González Huerta, Luz Victoria (coaut.) ; Sokolov Muratov, Mikhail Yurievich (coaut.) ;
Clasificación: AR/632.95097275 / E3
Contenido en: Revista Biología Tropical Vol. 53, no. 1-2 (marzo-junio, 2005 ), p. 141-151 ISSN: 0034-7744
Bibliotecas: Chetumal
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SIBE Chetumal
B6460 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
PDF
Resumen en: Español |
Resumen en español

We analized acute toxicity in white shrimp (Litopenaeus vannamei) postlarvae exposed to two chlorinated pesticides, DDT and endosulfan, under laboratory conditions during 168 hours, with controlled temperature (29 ± 1°C), salinity (3 ±1‰) and pH (8 ± 1). Median lethal concentrations (LC50), “incipient” LC50, median lethal time (LT50) the “maximum acceptable concentration of the toxic compound” (MACT) and “the safety level” (SL) were determined. The concentration of the compounds at which organism growth was reduced by 5 and 50% (EC5 and EC50), as well as changes in oxygen consumption patterns were determined in the surviving postlarvae. They were very sensitive to both compounds and DDT was thrice as toxic as endosulfan. Growth rate decreased 50 % and 80 % with endosulfan and DDT, respectively, at the experimental pestice concentration. The low resistance of postlarvae to DDT and endosulfan suggests that additional inflow of these pesticides into the aquatic system could affect the rate of shrimp production in the area.


8.
Tesis
Efecto tóxico del DDT en postlarvas de camarón blanco (litopenaeus vannamei) de la Costa de Chiapas / Hermila Yadira Siu Rodas
Mas, Jean François ;
Tapachula, Chiapas, México : Universidad Autónoma de Chiapas. Facultad de Ciencias Químicas , 2001
Clasificación: CH/639.543 / S5
Bibliotecas: San Cristóbal , Tapachula
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SIBE San Cristóbal
SFA002634 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 1
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SIBE Tapachula
ECO020006093 (Disponible) , ECO020004629 (Disponible)
Disponibles para prestamo: 2