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Análisis metodológico para la extracción de ADN metagenómico en muestras coprológicas humanas / Ivar Jasiel Torres Romero
Torres Romero, Ivar Jasiel (autor) ; Cruz Cadena, Raúl Edgardo (director) ; Díaz López, Héctor Ochoa (director) ; Méndez Flores, Orquídia Guadalupe (directora) ;
Ocozocoautla de Espinosa, Chiapas, México : Universidad Autónoma de Chiapas. Escuela de Ciencias Químicas , 2018
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Resumen en español

En años recientes se han realizado descubrimientos sobre la microbiota intestinal y su relación con enfermedades y síndromes metabólicos en los humanos, además de que regulan algunas funciones fisiológicas como la respuesta inmune y señalización molecular. Estos descubrimientos han sido posibles mediante análisis moleculares de nueva generación como la metagenómica. Para realizar estos estudios se utiliza material genético a partir de la materia fecal humana, que es de recolección no invasiva para el donador. La extracción de ADN se vuelve difícil de realizar debido a la diversidad de material genético contenido en la muestra, por lo que es importante instaurar un método que asegure la extracción de ADN de alto rendimiento para realizar estudios moleculares como el análisis metagenómico. El objetivo de este trabajo fue analizar la metodología de extracción de ADN haciendo un comparativo entre dos tipos de detergentes utilizados en la lisis celular para determinar cuál de los dos demuestra un mejor desempeño en el proceso de extracción. La comparación se hizo con base a la concentración y pureza de ADN obtenido por medio de espectrofotometría y la calidad cualitativa de ADN determinada por electroforesis en gel de agarosa. Los detergentes utilizados fueron CTAB y SDS. Los resultados demostraron que el CTAB es un detergente con mayor rendimiento para la extracción de ADN metagenómico.

Índice

I. Resumen
II. Introducción
III. Marco teórico
3.1 Ácidos nucleicos
3.2 Métodos de extracción
3.3 Pureza de ácidos nucleicos
3.4 Análisis moleculares
IV. Antecedentes metodológicos
4.1 Uso de detergentes (CTAB Y SDS)
4.2 Uso de disolventes orgánicos
4.3 Metagenómica
V. Planteamiento del problema
VI. Hipótesis
VII. Justificación
VIII. objetivo general
IX. Objetivos específicos
X. Metodología
10.1 Participantes y muestra
10.2 Materiales, equipos y reactivos
10.3 Extracción de DNA
10.4 Cuantificación de DNA
10.5 Electroforesis en gel de agarosa
XI. Resultados
11.1 Características generales de los participantes y la muestra
11.2 Normalidad de la muestra
11.3 Cuantificación de ADN
11.4 Pureza de ADN
11.5 Electroforesis en gel de agarosa
XII. discusión
XIII. Conclusiones
XIV. Referencias
Anexo 1
Cuestionario
Anexo 2